巨无霸们押送威震天返回塞博特恩时，威震天逃脱，率先抵达塞博特恩，并完全控制了塞博特恩，击落了巨无霸们的飞船。威震天企图消灭全部有机形态元素，在塞博特恩上撒播病毒，抽取了所有变形金刚的火种，以将其纯化为无机化力量。擎天圣率领小分队顽强抵抗，在圣贤的指引下，激发了塞博特恩内部的有机能源，对抗威震天的机械兵军团（武装兽）。最后，威震天成功收集所有变形金刚的火种并纯化自己，变得异常强大，企图利用魔力神球之钥将塞博坦完全无机化，擎天圣为阻止威震天而与其同归于尽。塞博坦转变为充满绿色的有机星球，擎天圣用生命换来了塞博坦有机与无机的和谐统一。
每个角色都栩栩如生，他们的性格和动机都得到了充分的展现，令人印象深刻。
这剧剧情拖沓，感情线莫名其妙，看得人直打瞌睡，差评。
整部电影的节奏缓慢，缺乏高潮和亮点，让人看得昏昏欲睡。
剧情挺接地气，就是有些桥段太刻意，煽情过了头。
影片探讨了深刻的社会议题，引人深思，具有很高的艺术价值。